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一、Lablefree非标记定量蛋白质组
Lablefree即非标记的定量蛋白质组学，不需要对比较样本做特定标记处理，只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化，通常用于分析大规模蛋白鉴定和定量。
二、Lablefree非标记定量蛋白质组技术优势
严格的质量控制： 数据稳定、重现性好，可平行处理多个样品。
专业的数据分析： 专业的统计和生信分析平台，提高数据挖掘力度，出版级的图表，全面的分析报告。
优点：适合研究“绝对有无蛋白”。能够鉴别低丰度肽段。性价比高。
缺点：对液相色谱及串联质谱的稳定性和重复性要求较高，定量准确度稍低。
三、实验流程
图1 蛋白样品制备——>样品质检——>酶解——>每个样品单独进行质谱分析——>差异蛋白筛选及生物信息学分析
四、分析流程
图2 Label-free定量蛋白质组学生物信息分析基本流
五、应用领域
寻找差异表达蛋白
生物标志物筛选
疾病标志物筛选
六、仪器平台
Label-free质谱平台：Orbitrap
Fusion Lumos Tribrid 三合一质谱仪（本领域顶尖质谱仪，官方链接：https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/FETD2-10001?SID=srch-srp-FETD2-10001）
七、样品要求
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样品类型 |
样品要求 |
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蛋白提取物 |
蛋白总量≥500µg，浓度≥1µg/µl；IP类蛋白总量≥10µg，浓度≥0.25µg/µl |
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细胞样品 |
细胞量≥3-5×106 细胞沉淀体积约30-50µl |
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组织样品 |
新鲜动物组织干重≥100mg；植物湿重≥1g；微生物≥200mg |
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体液样品 |
全血≥5ml；血清/血浆≥500µl；尿液≥50ml唾液、羊水、脑脊液等体液≥5ml |
八、参考文献
1. Gong, Y.; Pu, W.; Jin, H.; Yang, P.; Zeng, H.; Wang, Y.; Pang, F.; Ma, X., Quantitative proteomics of CSF reveals potential predicted biomarkers for extranodal NK-/T-cell lymphoma of nasal-type with ethmoidal sinus metastasis. Life Sci 2018, 198, 94-98.
2. Collins, M. A.; An, J.; Hood, B. L.; Conrads, T. P.; Bowser, R. P., Label-Free LC-MS/MS Proteomic Analysis of Cerebrospinal Fluid Identifies Protein/Pathway Alterations and Candidate Biomarkers for Amyotrophic Lateral Sclerosis. Journal of proteome research 2015, 14 (11), 4486-501.
