一、项目简介

检测mRNA翻译效率对研究真核生物基因的表达调控具有重要意义，mRNA上结合的核糖体的数量体现该基因的翻译效率。Polysome profling利用核糖体沉降系数较大的特性，用蔗糖密度梯度离心的方法分离多聚核糖体。一条mRNA上结合的核糖体数量越多，在梯度离心时的沉降速率就会越快，因此结合不同数量核糖体的mRNA通过超速离心而分离，结合新一代高通量测序技术，对分离的mRNA测定其序列，通过生物信息学分析，揭示真核生物在发育，病变，凋亡，肿瘤发生等生命活动中的基因表达水平。

二、技术路线

三、实验周期

项目周期通常在 20 - 30 个工作日
   若有特殊的分析要求需根据具体情况而定

四、信息分析

1）鉴定全基因组范围内编码基因与非编码基因

2）分析全基因组范围内转录本翻译效率情况，鉴定不同翻译效率的基因

3）新的非编码RNA翻译功能的鉴定，分子功能鉴定

五、送样要求

样品培养到合适时间点时，需要在培养基中添加放线菌酮(CHX, 终浓度为100μg /mL)处理，液氮速冻后保存于-80度。（根据具体实验和样品类型调整，详情请咨询）

六、参考文献

a.Konig J, Zarnack K, Rot G, Curk T, Kayikci M, Zupan B, Turner DJ, Luscombe NM, Kren BT, Wong PY, Shiota A, Zhang X, Zeng Y, Steer CJ. 2009. Polysome trafficking of transcripts and microRNAs in regenerating liver after partial hepatectomy. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol 297: G1181-1192.

b.Kudla M, Karginov FV. 2016. Measuring mRNA Translation by Polysome Profiling. Methods Mol Biol 1421: 127-135.

c.Li YF, Mahalingam R, Sunkar R. 2017. Isolation of Polysomal RNA for Analyzing Stress-Responsive Genes Regulated at the Translational Level in Plants. Methods Mol Biol 1631: 151-161.